U srednjem vijeku red masona bio je vrlo raširen, sastojao se od najnaprednijih umova koji su vodili društvo u 17. stoljeću: Buckle, Bacon, Leibniz, Jan Comenius, osobe kraljevske krvi. Cilj masona je, prema njihovim izjavama, nositi i očuvati duhovne blagodati za čitavo čovječanstvo. Danas ovaj poredak takođe uključuje hiljade ljudi. Poznate masonske tajne bile su obilježje ove zajednice.
Promjena u povelji masona dogodila se 1717. godine kada je masonstvo postalo "špekulativno" (ili "filozofsko"). Svim članovima bratstva naređeno je da drže u tajnosti određene riječi, znakove i rukovanja, morali su ih poštovati i suzdržavati se od javnog pokazivanja. Vremenom je misterija postala sastavni dio kulta, i unatoč objavljivanju mnogih tajni 1730. godine, masoni nisu prestajali poštivati svoju povelju.
Jedna od glavnih tajni slobodnih zidara bila je neobična i vrlo složena ceremonija prijema novih članova u društvo (loža). Povezanih očiju, "laik" je doveden na određeno mjesto, gdje su se već okupili ostatak članova lože. Stupajući na upisane znakove (njihovo značenje bilo je otkriveno tek nakon pristupanja redu), svečano čita tekst zakletve. U slučaju izdaje ili odavanja tajne, izdaje dušu na vječno prokletstvo, a tijelo na smrt od mača braće. Novi član nagrađen je bijelom kožnom pregačom, simbolom bratstva zidara, muškim rukavicama i srebrnom lopaticom - od sada je pozvan da "izgradi Veliki hram čovječanstva".
Ceremonija bi mogla biti malo drugačija za različite lože - primljeni članovi prenijeli su tajne znakove, tajne riječi, figurice, tetovirali su ih po kojima bi ih drugi masoni mogli prepoznati. Još tajnija i malo poznatija bila je ceremonija inicijacije u više stepene - općenito, bilo je 33 koraka na hijerarhijskoj ljestvici masonstva.
Načelo masonskog poretka temelji se na tajnosti. Moderno masonstvo smatra se dovoljno snažnim, stoga ne vidi potrebu za zavjerama, ali opća svijest ne može pokriti tajno djelo, skriveno masonstvo. Zavjetovavši se da će šutjeti na ceremoniji pridruživanja loži, član lože je od sada dužan izvršavati sve naredbe viših članova.
Učenik nema pojma o radu prijatelja koji zauzvrat ne zna ništa o ciljevima i radu gospodara. Učenici poznaju samo nekoliko članova lože, ostali su im nepoznati. Isto tako, gospodar poznaje svog neposrednog pretpostavljenog, a ne zna ni ostatak (iako, možda, oni žive pored njega). Takav sistem tajnog društva djeluje na svim nivoima hijerarhije. Naredba data odozgo izvršava se implicitno i tajno.
Zidari, koji su na donjim stepenicama, igraju ulogu samo izvršitelja. Glavne tajne skrivene su na vrhu piramide - znaju ih samo adepti i prinčevi masonske lože. Oni sami određuju prave ciljeve poretka - i upravljaju svima ostalima. Sveto znanje bilo je tako pažljivo skrivano od drugih da danas mnoge tajne prošlih stoljeća više nije moguće naučiti.