Mnogi ljudi znaju sliku umjetnika Ilje Repina "Ivan Grozni i njegov sin Ivan 16. novembra 1581. godine", koja prikazuje pokajanje cara koji je zadao kobni udarac. Pitanja o tome je li Ivan Vasiljevič bio sinicid i da li je on kriv za prinčevu smrt, i dalje ostaju neriješena. Misterija smrti sina Ivana IV još je jedna nerazjašnjena misterija.
U spisima papinog legata Antonija Passevina, koji je u to vrijeme bio na dvoru Ivana Groznog, naznačeno je da je ruski monarh suprugu Elene pronašao u donjoj haljini u sobama svog sina. U to vrijeme Elena je bila trudna i nije očekivala da joj iko uđe. Ivan IV je pao u ljutnju, žestoko pretukao snahu štapom, uslijed čega je doživjela spontani pobačaj. U to vrijeme ulazi Carevič Ivan i, vidjevši kako njegov otac tuče Elenu, zauzima se za svoju ženu. Kralj u naletu bijesa juriša na sina i udara ga palicom po glavi. Udarac je pogodio sljepoočnicu i ispostavio se kobnim, nekoliko dana kasnije sin Ivana Groznog umire.
Godine 1963. sovjetski naučnici izvršili su istraživanje koštanih ostataka Ivana IV i njegovog sina Ivana. Na osnovu njihovih rezultata u ostacima je pronađena velika količina žive. Otkud je ova supstanca mogla doći, naučnici su mogli samo nagađati.
U isto vrijeme, prinčeva lobanja u vrijeme ekshumacije bila je u lošem stanju zbog propadanja koštanog tkiva. Navedeni razlog nije omogućio potvrđivanje klasične verzije Ivanove smrti od udarca. Međutim, kosa pokojnika bila je sačuvana u dobrom stanju, a istraživači na njima nisu pronašli tragove krvi, što je indirektno opovrgnulo ovu verziju smrti.
Može se pretpostaviti da je Ivana, poput njegovog oca Ivana IV, netko otrovao, inače kako se može objasniti ogromna količina žive u ostacima kraljevskih osoba.
Možda je carevim štapom bio udarac u glavu carevića, ali to nije bio uzrok Ivanove smrti, već se poklopio samo s trenutkom kada je otrov, nakupljen u tijelu carevog sina, dao svoj smrtonosni učinak.
